El aprovechamiento de los recursos naturales representa una de las actividades más dinámicas del país. Dentro del enfoque sustentable, OTERRA desarrolla actividades de investigación que tienen como propósito mejorar la base de conocimientos y desarrollar herramientas y modelos avanzados para la gestión sostenible de los recursos naturales, permitiendo predecir el comportamiento de los ecosistemas y su restauración, así como atenuar la degradación y pérdida de elementos estructurales y funcionales del medio ambiente (en lo que se refiere a la biodiversidad, el agua, el suelo, el aire y los recursos marinos).